Microbiologie e virologia moleclare

La diagnostica microbiologica e virologica molecolare è un’importante area della medicina che si basa sull’utilizzo delle tecniche molecolari avanzate per identificare e caratterizzare i microrganismi e i virus a livello genetico presenti in campioni biologici.
Queste tecniche consentono una maggiore precisione, sensibilità e rapidità rispetto ai metodi tradizionali. Inoltre, la microbiologia molecolare e la virologia molecolare si integrano spesso con altre discipline, come l’epidemiologia, la bioinformatica e la medicina molecolare, per ottenere una visione completa delle malattie infettive e sviluppare nuove strategie di diagnosi e terapia oltre alla prevenzione.

Le tecniche utilizzate sono:

• PCR (Reazione a catena della polimerasi) e Real-time PCR (PCR in tempo reale)

consente di amplificare specifiche sequenze di DNA o RNA di un microrganismo o di un virus presente in un campione. Questa amplificazione permette la rilevazione e l’identificazione specifica del patogeno. La PCR può essere utilizzata per la diagnosi di infezioni batteriche, virali o fungine, nonché per la rilevazione di geni di resistenza agli antibiotici.

Mentre la Real-time PCR  consente la quantificazione simultanea del materiale genetico di un patogeno. La real-time PCR fornisce informazioni sulla quantità di DNA o RNA virale o batterico presente nel campione, consentendo la valutazione della carica virale o batterica e il monitoraggio della risposta al trattamento.

• Sequenziamento del DNA/RNA e Sequenziamento di nuova generazione (NGS)

Il sequenziamento del DNA o dell’RNA consente l’identificazione precisa della sequenza genetica di un microrganismo o di un virus. Questa tecnica può essere utilizzata per identificare specie batteriche o virali specifiche, caratterizzare le varianti genetiche o i sottotipi dei patogeni e determinare la resistenza agli antibiotici o la sensibilità ai farmaci antivirali.
Il NGS è una tecnologia avanzata che permette di sequenziare milioni di frammenti di DNA o RNA contemporaneamente. Questa tecnica consente una copertura genetica estesa e può essere utilizzata per identificare nuovi patogeni, caratterizzare i genomi virali o batterici e studiare la diversità genetica dei microrganismi